BioInformatique
Vaste domaine que le binôme "informatique" et "biologie ". Les documents
que vous trouverez ne sont pas des cours, mais des notes ou des
compléments sur des problèmes particuliers qui font partie de
l'enseignement de BioInformatique dans les cursus des Sciences de la
Vie. Certains compléments ou notes n'ont pas été remis à jour et datent
des années 1995-1997.
Une méthode de résolution du problème des cartes de restriction par la méthode de partition d'un ensemble vous est exposée (
en Anglais)
Notes de cours ou travaux dirigés
Une introduction à la bioinformatique avec un approfondissement de la notion de ressemblance de séquences moléculaires :
- Introduction à la bioinformatique (
1995 - Maîtrise)
- Introduction à la bioinformatique (
2004 - Licence 2ème année)
Quelques méthodes de prédiction de structure secondaire, d'antigénicité
des protéines sont passées en revue. Ces méthodes sont soit des profils
d'index, soit des méthodes statistiques (théorie de l'information), soit
des méthodes vectorielles.
- Prédictions de structure (
1996)
Une introduction à la phylogénie et plus particulièrement aux méthodes phénétiques :
- Introduction à la phylogénie moléculaire
- Neighbor-joining Method, vous pouvez aussi lire la version html
Carte de restriction
Le programme construit les cartes de restrictions d'une molécule d'ADN
par des endonucléases, compatibles avec les fragments obtenus après
simple et double digestion. L'algorithme est basé sur les partitions
d'ensembles et une règle d'enchaînement des fragments.
- Construction de cartes de restrictions
lien
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