Biochimie structurale
Ce sont les notions classiques de la biochimie structurale de la
première année et de la deuxième année de Licence (cursus LMD), ou
anciennement DEUG mention Sciences de la Vie. Les différents documents
(tous dans le format de fichier de type "pdf") correspondent à une
enseignement d'environ 90h étudiant (cours, travaux dirigés).
1) L'eau
Sont abordées les propriétés physico-chimiques, ionisantes de l'eau. Un
chapitre est consacré aux équilibres acido-basiques, à la force des
acides et bases et aux courbes de titrage. Après avoir défini les
solutions "tampon", de nombreux exemples et calculs de solution tampon
sont explicités.
- Cours (32 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
2) Les glucides
Les propriétés physiques et chimiques des oses vous feront découvrir
leur chiralité, la représentation de Fisher, leur structure cyclique et
la représentation de Haworth. Les oligosides, polyosides homogènes et
hétérogènes, les plus importants, constituent le dernier chapitre.
- Cours (36 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
3) Les lipides
Les lipides ont été regroupés en trois grandes catégories : les lipides vrais comprenant les acides gras, les lipides simples (acylglycérols, cérides, stérides), puis les lipides complexes regroupant les glycérophospholipides, les glycéroglycolipdes et les sphingolipides, et enfin les composés à caractère lipidique (lipoide), tels les dérivés de l'acide arachidonique, les terpènes et les composés terpéniques et enfin les stéroides.
- Cours (35 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
4) Les acides nucléiques
Une dizaine de pages décrivent les molécules de base (base, nucléoside,
nucléotide) qui forment les acides nucléiques. Après la structure
primaire des acides nucléiques (liaison phosphodiester essentiellement),
les structures secondaires présentes dans l'ADN ou les ARN sont
détaillées.
- Cours (29 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
5) Les aminoacides - protéines
Une vingtaine de pages sont consacrées aux aminoacides standard des
protéines, à leurs propriétés chimiques, physiques, ioniques. Après les
propriétés géométriques de la liaison peptidique, les propriétés
chimiques et ioniques des peptides sont décrites. Une dizaine de pages
traitent de la structure primaire et de la structure secondaire des
protéines.
- Cours (51 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
6) Introduction à la cinétique enzymatique
Une vingtaine de pages sont consacrées à la cinétique enzymatique : les
notions d'ordre de réaction, de catalyse sont abordées. Les modèles de
cinétique enzymatique de Michaëlis-Menten et de Briggs-Haldane sont
traités ave les significations des différentes constantes cinétiques
classiques, ainsi que les diverses représentations graphiques utilisées
en biochimie. Les notions d'activité, d'activité spécifique sont
définies.
- Cours (21 pages)
- Exercices (énoncés)
- Eléments de réponse
Compléments de détail
Des étudiants ont demandé une explication détaillée de quelques points
abordés dans les cours ou les éléments de réponse, voici les plus
significatifs :
- Calcul détaillé des propriétés remarquables de la courbe de titrage (eau, p 15)
- Résolution détaillée (eau, p 22)
- Correction détaillée de l'exercice n° 7 de l'eau
- Détail du calcul des pourcentages des formes (protéines, p 31)
- Correction détaillé de l'exercice n° 7 des protéines
lien direct du site:
http://sites.univ-provence.fr/wabim/d_agora/bioch.html
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Lun 26 Nov 2012 - 22:21
