Big Brother
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 | Sujet: Module : "Génomique fonctionnelle et protéomique"  Sam 26 Jan 2013 - 7:05 | |
| Génomique fonctionnelle, protéomique, métabolomique
- 1. Introduction
- 2. Les méthodes de séquençage d'acides nucléiques et l'acquisition des données
- 3. Réponses des plantes aux stress biotiques et abiotiques - rôles des protéines LEA et des protéines de choc thermique (HSP)
- 4. Arabidopsis thaliana et les plantes modèles
- 5. Transcriptomique
- a. Analyse des données d'expression issues des puces à ADN
- b. Effet de différents stress (ABA, dessication, froid, salinité) sur l'expression de génes d'Arabidopsis thaliana - Analyse d'article
- c. Les marqueurs de séquences exprimées ou "EST" ("Expressed Sequences Tags")
- d. EST et puces à ADN pour l'étude du comportement de l'abeille Apis mellifera - Analyse d'article
- e.
Quelques méthodes d'analyse quantitative du transcriptome et de
l'expression des gènes (SAGE et ses dérivés - MPSS - CAGE - RNA-seq)
- 6. Protéomique
- a. Notions théoriques
- b. Applications
- 7. Métabolomique : modèles de reconstruction métabolique à l'échelle d'un génome, réseau de régulation métabolique
- 8. L'annotation en génomique fonctionnelle et protéomique
- 9. Bioinformatique
- a. Algorithmes et programmes de comparaison de séquences
- b. Les matrices de substitution
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